?url_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Adc&rft.relation=http%3A%2F%2Fwww.badankebijakan.kemkes.go.id%2Frepositori%2Fid%2Feprint%2F673%2F&rft.title=Identifikasi+dan+Karakterisasi+Strain+Mycobacterium+tuberculosis+Dari+Isolat+Dahak+Pasien+Tuberkulosis+Paru+Di+Indonesia+(Tahap+III)&rft.creator=Lisdawati%2C+Vivi&rft.creator=Gitawati%2C+Retno&rft.creator=Sukmawati&rft.subject=WF+140-900+Diseases+of+the+Respiratory+System&rft.description=Identifikasi+dan+karakterisasi+Mycobacterium+tuberculosis+(Mtb)+di+Indonesia+merupakan+salah+satu+upaya+untuk+mengoptimalisasi+sensitifitas+dan+spesififitas+diagnostik+molekular+TB+di+Indonesia.+Uji+Loop-mediated+isothermal+amplification+(LAMP)+dan+deteksi+mutasi+di+gen+rpoB+termasuk+metode+diagnostik+molekuler+yang+telah+direkomendasikan+WHO+sebagai+alternatif+diagnostik+TB+konvensional.+Penelitian+ini+bertujuan+untuk+mengembangkan+primer+diagnostik+LAMP+dari+gen+gyrB+Mtb+H37Rv+dan+primer+diagnostik+resistensi+dari+gen+rpoB+Mtb+spp.+dengan+menggunakan+data+epidemiologi+molekuler+Mtb+di+Indonesia.+Penelitian+merupakan+penelitian+laboratorium+eksperimental+dengan+desain+potong+lintang.+Empat+ratus+tiga+puluh+tujuh+DNA+Mtb+yang+berasal+dari+spesimen+dahak+pasien+suspek+TB+dengan+BTA+positif+dari+16+ibukota+propinsi+di+Indonesia%2C+diuji+spoligotyping+di+laboratorium+Bakteriologi+dan+Biomolekular%2C+Pusat+1-Balitbangkes+dan+MIRU-VNTR+di+laboratorium+TB+Lembaga+Biologi+Molekuler+Eijkman.+Hasil+kemudian+dibandingkan+dengan+the+fourth+international+spoligotyping+database+(SpolDB4).+Kontrol+mutu+eksternal+dilakukan+di+Departemen+Patologi+Klinik%2C+RSHS-Bandung.+Dendrogram+Mtb+disusun+di+Lembaga+Biologi+Molekuler+Eijkman+(BioNumerics+v6.0).+Uji+resistensi+dilaksanakan+di+Laboratorium+Bakteriologi%2C+Pusat+1-Balitbangkes+dengan+kontrol+mutu+di+Balai+Besar+Laboratorium+Kesehatan+(BBLK)-Surabaya%2C+sementara+pengembangan+primer+diagnostik+resistensi+dari+gen+rpoB+Mycobacteria+spp+dilakukan+di+Laboratorium+Biomolekular%2C+RSHS-Bandung.+Uji+optimasi+LAMP+dan+sekuensing+untuk+mengidentifikasi+daerah+highly+conserved+pada+gyrB+Mtb+sampel+dan+desain+primer+LAMP+(Primer+Explorer+V3+EIKEN-Genome+site)+dilakukan+di+Laboratorium+Biomolekular%2C+Pusat+1-Balitbangkes%2C+yang+dilanjutkan+dengan+optimasi+primer+LAMP+Indonesia+pada+serial+larutan+DNA+Mtb+H37Rv+dan+DNA+sampel+Mtb.+Studi+epidemiologi+molekular+menunjukkan+bahwa+tipe+galur+Beijing+merupakan+mayoritas+tipe+Mtb+di+wilayah+Jawa%2C+Sumatera+dan+Kalimantan+sementara+tipe+Mtb+famili+EAI+dan+LAM+mayoritas+di+wilayah+Timur+Indonesia.+Pola+resistensi+Mtb+menunjukkan+lebih+kurang+70%25+kuman+masih+suseptibel+dengan+Obat+Anti+Tuberkulosis+(OAT)+lini+I+dimana+primer+TR8+dan+primer+TR9+dari+gen+rpoB+Mycobacterium+spp+dapat+mengamplifikasi+Mtb+sampel+baik+yang+mutasi+maupun+yang+tidak+serta+berhasil+diperoleh+protokol+kerja+teroptimasi.+Terdapat+sekuens+highly+conserved+di+daerah+nt+1098-1394+gen+gyrB+Mtb+dalam+sampel+penelitian+dengan+prototipe+primer+LAMP+Indonesia+yang+berasal+dari+salah+satu+sekuens+DNA+sampel+berada+di+daerah+nt+1097-1298+gyrB+Mtb.+Uji+optimasi+menunjukkan+primer+Indonesia+mampu+mengamplifikasi+hingga+%5B100%5D+fg%2Ful+DNA+Mtb+H37Rv+dan+sensitifitas+uji+pada+sampel+pasien+TB+dengan+BTA+positif+(positivity+rate)+adalah+97%2C6%25+(82%2F84).+Hasil+membuktikan+tingginya+diversitas+genotipe+Mtb+di+Indonesia+dengan+mayoritas+galur+Mtb+berbeda+di+Sumatera%2C+Kalimantan+dan+Jawa+dibanding+di+wilayah+Timur+Indonesia.+Adanya+pola+resistensi+MDR+yang+cukup+tinggi+terhadap+Mtb+yang+bersirkulasi+meski+sebagian+besar+masih+septibel+serta+berhasil+dikembangkan+Primer+LAMP+desain+Indonesia+yang+terbukti+memiliki+sensitifitas+uji+lebih+tinggi+dibanding+primer+set+komersial+dan+mampu+mengenali+seluruh+genotipe+Mtb+yang+ada.&rft.publisher=Pusat+Penelitian+dan+Pengembangan+Bio+Medis+dan+Farmasi&rft.date=2010&rft.type=Monograph&rft.type=NonPeerReviewed&rft.format=text&rft.language=en&rft.identifier=http%3A%2F%2Fwww.badankebijakan.kemkes.go.id%2Frepositori%2Fid%2Feprint%2F673%2F1%2F66a%2520BMF%2520-%2520IDENTIFIKASI%2520dan%2520KARAKTERISASI%2520STRAIN%2520Mycobacteri.pdf&rft.identifier=++Lisdawati%2C+Vivi+and+Gitawati%2C+Retno+and+Sukmawati++(2010)+Identifikasi+dan+Karakterisasi+Strain+Mycobacterium+tuberculosis+Dari+Isolat+Dahak+Pasien+Tuberkulosis+Paru+Di+Indonesia+(Tahap+III).++Project+Report.+Pusat+Penelitian+dan+Pengembangan+Bio+Medis+dan+Farmasi.+++++